电影的最后，长大的真嗣在车站等人还带着DSS项圈，虽然长大了，但一切都定格在了决战的时候，这一切只是想像的世界，凌波丽死了，明日香也变成使徒和EVA一起死了，最后真希波在海边找到了真嗣，说明真希波也死了（真希波对真嗣说过的到哪里都会找到你这句话真的是讽刺），几乎所有人为了阻止第四次冲击全部牺牲，只有村子结界中的人还有从飞船逃生的人活了下来，飞船保留下来的DNA会让这个世界继续，不过新世界再也不会有为之奋斗的主角们了。因为主角们就是我们，主角们成长了，我们也长大了，在现实世界里继续奋斗吧。